MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ND02 plasmid unnamed

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014728	ACAG	2	8	20	27	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014728	A	7	7	110	116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014728	CGG	2	6	119	124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014728	A	6	6	136	141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014728	A	7	7	152	158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014728	TTTC	2	8	179	186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014728	ATA	2	6	242	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014728	AGG	2	6	265	270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014728	ACAG	2	8	336	343	50 %	0 %	25 %	25 %	312984525
10	NC_014728	AAG	2	6	476	481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984525
11	NC_014728	GTA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312984525
12	NC_014728	GAA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984525
13	NC_014728	CAG	2	6	539	544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312984525
14	NC_014728	ACA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984525
15	NC_014728	AG	3	6	765	770	50 %	0 %	50 %	0 %	312984525
16	NC_014728	AGA	2	6	772	777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984525
17	NC_014728	CGG	2	6	815	820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312984525
18	NC_014728	ATT	2	6	849	854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312984525
19	NC_014728	AAG	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014728	ATTG	2	8	1045	1052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014728	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984526
22	NC_014728	GAA	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984526
23	NC_014728	GGC	2	6	1319	1324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312984526
24	NC_014728	AGGGCT	2	12	1337	1348	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312984526
25	NC_014728	CTTTT	2	10	1394	1403	0 %	80 %	0 %	20 %	312984526
26	NC_014728	AAC	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984526
27	NC_014728	TGA	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312984526
28	NC_014728	AAGGC	2	10	1478	1487	40 %	0 %	40 %	20 %	312984526
29	NC_014728	AAC	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984526
30	NC_014728	GAAG	2	8	1588	1595	50 %	0 %	50 %	0 %	312984526
31	NC_014728	GAT	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312984526
32	NC_014728	ATT	2	6	1728	1733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014728	AACT	2	8	1795	1802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014728	T	6	6	1819	1824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014728	A	6	6	1863	1868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014728	T	7	7	1906	1912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014728	CAA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014728	ATA	3	9	1997	2005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014728	A	7	7	2012	2018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014728	GTT	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014728	TA	4	8	2171	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014728	TCT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014728	TGT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014728	CAGGC	2	10	2264	2273	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014728	T	6	6	2292	2297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014728	AAAG	2	8	2313	2320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014728	AAC	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014728	TGA	2	6	2406	2411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312984527
49	NC_014728	CAGC	2	8	2418	2425	25 %	0 %	25 %	50 %	312984527
50	NC_014728	CAGC	2	8	2431	2438	25 %	0 %	25 %	50 %	312984527
51	NC_014728	TAC	2	6	2442	2447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312984527
52	NC_014728	A	6	6	2468	2473	100 %	0 %	0 %	0 %	312984527
53	NC_014728	GGC	2	6	2482	2487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312984527
54	NC_014728	AAT	2	6	2523	2528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312984527
55	NC_014728	AGA	2	6	2538	2543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984528
56	NC_014728	GCGTGA	2	12	2544	2555	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312984528
57	NC_014728	GTA	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312984528
58	NC_014728	CAA	2	6	2592	2597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984528
59	NC_014728	CAA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984528
60	NC_014728	TTA	2	6	2633	2638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312984528
61	NC_014728	GGCT	2	8	2864	2871	0 %	25 %	50 %	25 %	312984529
62	NC_014728	TA	3	6	2892	2897	50 %	50 %	0 %	0 %	312984529
63	NC_014728	GCG	2	6	2956	2961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312984529
64	NC_014728	TAAT	2	8	3004	3011	50 %	50 %	0 %	0 %	312984529
65	NC_014728	CTA	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312984529
66	NC_014728	AGCA	2	8	3071	3078	50 %	0 %	25 %	25 %	312984529
67	NC_014728	CAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312984529
68	NC_014728	AGA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984529
69	NC_014728	ATC	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312984529
70	NC_014728	CTA	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312984529
71	NC_014728	AGA	2	6	3452	3457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984529
72	NC_014728	TAG	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312984529
73	NC_014728	C	6	6	3541	3546	0 %	0 %	0 %	100 %	312984529
74	NC_014728	AGCC	2	8	3600	3607	25 %	0 %	25 %	50 %	312984529
75	NC_014728	A	6	6	3695	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	312984529
76	NC_014728	A	6	6	3716	3721	100 %	0 %	0 %	0 %	312984529
77	NC_014728	T	6	6	3748	3753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014728	T	6	6	3882	3887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014728	A	6	6	3888	3893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014728	CTTG	2	8	3951	3958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014728	A	6	6	3966	3971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014728	CTT	2	6	3998	4003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014728	AAC	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984530
84	NC_014728	CAG	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312984530
85	NC_014728	CTT	2	6	4124	4129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312984530
86	NC_014728	ACC	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312984530
87	NC_014728	TG	3	6	4171	4176	0 %	50 %	50 %	0 %	312984530
88	NC_014728	ACC	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312984530
89	NC_014728	GCCAG	2	10	4216	4225	20 %	0 %	40 %	40 %	312984530
90	NC_014728	GAA	2	6	4280	4285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984530
91	NC_014728	GAACCA	2	12	4407	4418	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312984530
92	NC_014728	GACT	2	8	4496	4503	25 %	25 %	25 %	25 %	312984530
93	NC_014728	ACA	2	6	4530	4535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984530
94	NC_014728	ATT	3	9	4578	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312984530
95	NC_014728	AG	3	6	4615	4620	50 %	0 %	50 %	0 %	312984530
96	NC_014728	TTG	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312984530
97	NC_014728	CAA	2	6	4843	4848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984530
98	NC_014728	AG	3	6	5004	5009	50 %	0 %	50 %	0 %	312984530
99	NC_014728	CAGA	2	8	5015	5022	50 %	0 %	25 %	25 %	312984530
100	NC_014728	TCA	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312984530
101	NC_014728	ATA	2	6	5104	5109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312984530
102	NC_014728	GAT	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312984530
103	NC_014728	CGG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312984530
104	NC_014728	TCT	2	6	5257	5262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312984530
105	NC_014728	AG	3	6	5281	5286	50 %	0 %	50 %	0 %	312984530
106	NC_014728	TC	3	6	5321	5326	0 %	50 %	0 %	50 %	312984530
107	NC_014728	AGA	2	6	5393	5398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984530
108	NC_014728	CTT	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312984530
109	NC_014728	ACA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984530
110	NC_014728	ACC	2	6	5509	5514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312984530
111	NC_014728	AAG	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984530
112	NC_014728	GACA	2	8	5582	5589	50 %	0 %	25 %	25 %	312984530
113	NC_014728	GACA	2	8	5600	5607	50 %	0 %	25 %	25 %	312984530
114	NC_014728	TC	3	6	5618	5623	0 %	50 %	0 %	50 %	312984530
115	NC_014728	TCATC	2	10	5659	5668	20 %	40 %	0 %	40 %	312984530
116	NC_014728	CTT	2	6	5680	5685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312984530
117	NC_014728	ATGTT	2	10	5746	5755	20 %	60 %	20 %	0 %	312984530
118	NC_014728	GAG	2	6	5778	5783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312984530
119	NC_014728	TTGAA	2	10	5812	5821	40 %	40 %	20 %	0 %	312984530
120	NC_014728	GAA	2	6	5882	5887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984530
121	NC_014728	TCT	2	6	5914	5919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312984530
122	NC_014728	GAAG	2	8	5963	5970	50 %	0 %	50 %	0 %	312984530
123	NC_014728	CAA	2	6	5981	5986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312984530
124	NC_014728	CA	3	6	6003	6008	50 %	0 %	0 %	50 %	312984530
125	NC_014728	GGC	2	6	6032	6037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312984530
126	NC_014728	AGA	2	6	6082	6087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312984530
127	NC_014728	AAG	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014728	TGGC	2	8	6124	6131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014728	TTTTG	2	10	6132	6141	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014728	GCCTG	2	10	6180	6189	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.